Mercurial > ift6266
annotate deep/stacked_dae/v_sylvain/nist_sda.py @ 307:ed0443f7aad4
Ajout d'une protection supplementaire (un peu de paranoia) ainsi que commentaires
author | SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca> |
---|---|
date | Wed, 31 Mar 2010 21:03:41 -0400 |
parents | 698313f8f6e6 |
children | bd6085d77706 |
rev | line source |
---|---|
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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changeset
|
1 #!/usr/bin/python |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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changeset
|
2 # coding: utf-8 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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changeset
|
3 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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changeset
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4 import ift6266 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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5 import pylearn |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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6 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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7 import numpy |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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8 import theano |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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9 import time |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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10 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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11 import pylearn.version |
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Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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12 import theano.tensor as T |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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|
13 from theano.tensor.shared_randomstreams import RandomStreams |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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14 |
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Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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15 import copy |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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16 import sys |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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17 import os |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
18 import os.path |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
19 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
20 from jobman import DD |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
21 import jobman, jobman.sql |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
22 from pylearn.io import filetensor |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
23 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
24 from utils import produit_cartesien_jobs |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
25 from copy import copy |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
26 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
27 from sgd_optimization import SdaSgdOptimizer |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
28 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
29 #from ift6266.utils.scalar_series import * |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
30 from ift6266.utils.seriestables import * |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
31 import tables |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
32 |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
33 from ift6266 import datasets |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
34 from config import * |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
35 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
36 ''' |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
37 Function called by jobman upon launching each job |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
38 Its path is the one given when inserting jobs: see EXPERIMENT_PATH |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
39 ''' |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
40 def jobman_entrypoint(state, channel): |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
41 # record mercurial versions of each package |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
42 pylearn.version.record_versions(state,[theano,ift6266,pylearn]) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
43 # TODO: remove this, bad for number of simultaneous requests on DB |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
44 channel.save() |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
45 |
238
9fc641d7adda
Possibilite de restreindre la taille des ensemble d'entrainement, valid et test afin de pouvoir tester le code rapidement
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
46 # For test runs, we don't want to use the whole dataset so |
9fc641d7adda
Possibilite de restreindre la taille des ensemble d'entrainement, valid et test afin de pouvoir tester le code rapidement
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
47 # reduce it to fewer elements if asked to. |
9fc641d7adda
Possibilite de restreindre la taille des ensemble d'entrainement, valid et test afin de pouvoir tester le code rapidement
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
48 rtt = None |
9fc641d7adda
Possibilite de restreindre la taille des ensemble d'entrainement, valid et test afin de pouvoir tester le code rapidement
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
49 if state.has_key('reduce_train_to'): |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
50 rtt = state['reduce_train_to'] |
238
9fc641d7adda
Possibilite de restreindre la taille des ensemble d'entrainement, valid et test afin de pouvoir tester le code rapidement
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
51 elif REDUCE_TRAIN_TO: |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
52 rtt = REDUCE_TRAIN_TO |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
53 |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
54 n_ins = 32*32 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
55 n_outs = 62 # 10 digits, 26*2 (lower, capitals) |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
56 |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
57 examples_per_epoch = NIST_ALL_TRAIN_SIZE |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
58 |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
59 series = create_series(state.num_hidden_layers) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
60 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
61 print "Creating optimizer with state, ", state |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
62 |
264
f14fb56b3f8d
ajout de fonctionnalitees pour deux testsets. Changements afin de pouvoir utiliser la nouvelle version de datasets
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
250
diff
changeset
|
63 optimizer = SdaSgdOptimizer(dataset=datasets.nist_all(), |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
64 hyperparameters=state, \ |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
65 n_ins=n_ins, n_outs=n_outs,\ |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
66 examples_per_epoch=examples_per_epoch, \ |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
67 series=series, |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
68 max_minibatches=rtt) |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
69 |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
70 parameters=[] |
282
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
71 #Number of files of P07 used for pretraining |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
72 nb_file=0 |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
73 if state['pretrain_choice'] == 0: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
74 print('\n\tpretraining with NIST\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
75 optimizer.pretrain(datasets.nist_all()) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
76 elif state['pretrain_choice'] == 1: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
77 #To know how many file will be used during pretraining |
307
ed0443f7aad4
Ajout d'une protection supplementaire (un peu de paranoia) ainsi que commentaires
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
282
diff
changeset
|
78 nb_file = int(state['pretraining_epochs_per_layer']) |
282
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
79 state['pretraining_epochs_per_layer'] = 1 #Only 1 time over the dataset |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
80 if nb_file >=100: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
81 sys.exit("The code does not support this much pretraining epoch (99 max with P07).\n"+ |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
82 "You have to correct the code (and be patient, P07 is huge !!)\n"+ |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
83 "or reduce the number of pretraining epoch to run the code (better idea).\n") |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
84 print('\n\tpretraining with P07') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
85 optimizer.pretrain(datasets.nist_P07(min_file=0,max_file=nb_file)) |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
86 channel.save() |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
87 |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
88 #Set some of the parameters used for the finetuning |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
89 if state.has_key('finetune_set'): |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
90 finetune_choice=state['finetune_set'] |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
91 else: |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
92 finetune_choice=FINETUNE_SET |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
93 |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
94 if state.has_key('max_finetuning_epochs'): |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
95 max_finetune_epoch_NIST=state['max_finetuning_epochs'] |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
96 else: |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
97 max_finetune_epoch_NIST=MAX_FINETUNING_EPOCHS |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
98 |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
99 if state.has_key('max_finetuning_epochs_P07'): |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
100 max_finetune_epoch_P07=state['max_finetuning_epochs_P07'] |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
101 else: |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
102 max_finetune_epoch_P07=max_finetune_epoch_NIST |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
103 |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
104 #Decide how the finetune is done |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
105 |
282
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
106 if finetune_choice == 0: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
107 print('\n\n\tfinetune with NIST\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
108 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
109 optimizer.finetune(datasets.nist_all(),datasets.nist_P07(min_file=nb_file),max_finetune_epoch_NIST,ind_test=1) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
110 channel.save() |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
111 if finetune_choice == 1: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
112 print('\n\n\tfinetune with P07\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
113 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
114 optimizer.finetune(datasets.nist_P07(min_file=nb_file),datasets.nist_all(),max_finetune_epoch_P07,ind_test=0) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
115 channel.save() |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
116 if finetune_choice == 2: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
117 print('\n\n\tfinetune with NIST followed by P07\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
118 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
119 optimizer.finetune(datasets.nist_all(),datasets.nist_P07(min_file=nb_file),max_finetune_epoch_NIST,ind_test=21) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
120 optimizer.finetune(datasets.nist_P07(min_file=nb_file),datasets.nist_all(),max_finetune_epoch_P07,ind_test=20) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
121 channel.save() |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
122 if finetune_choice == 3: |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
123 print('\n\n\tfinetune with NIST only on the logistic regression on top (but validation on P07).\n\ |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
124 All hidden units output are input of the logistic regression\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
125 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
126 optimizer.finetune(datasets.nist_all(),datasets.nist_P07(min_file=nb_file),max_finetune_epoch_NIST,ind_test=1,special=1) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
127 |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
128 |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
129 if finetune_choice==-1: |
282
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
130 print('\nSERIE OF 3 DIFFERENT FINETUNINGS') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
131 print('\n\n\tfinetune with NIST\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
132 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
133 optimizer.finetune(datasets.nist_all(),datasets.nist_P07(min_file=nb_file),max_finetune_epoch_NIST,ind_test=1) |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
134 channel.save() |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
135 print('\n\n\tfinetune with P07\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
136 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
137 optimizer.finetune(datasets.nist_P07(min_file=nb_file),datasets.nist_all(),max_finetune_epoch_P07,ind_test=0) |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
138 channel.save() |
282
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
139 print('\n\n\tfinetune with NIST (done earlier) followed by P07 (written here)\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
140 optimizer.reload_parameters('params_finetune_NIST.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
141 optimizer.finetune(datasets.nist_P07(min_file=nb_file),datasets.nist_all(),max_finetune_epoch_P07,ind_test=20) |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
142 channel.save() |
282
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
143 print('\n\n\tfinetune with NIST only on the logistic regression on top.\n\ |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
144 All hidden units output are input of the logistic regression\n\n') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
145 optimizer.reload_parameters('params_pretrain.txt') |
698313f8f6e6
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
264
diff
changeset
|
146 optimizer.finetune(datasets.nist_all(),datasets.nist_P07(min_file=nb_file),max_finetune_epoch_NIST,ind_test=1,special=1) |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
147 channel.save() |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
148 |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
149 channel.save() |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
150 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
151 return channel.COMPLETE |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
152 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
153 # These Series objects are used to save various statistics |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
154 # during the training. |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
155 def create_series(num_hidden_layers): |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
156 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
157 # Replace series we don't want to save with DummySeries, e.g. |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
158 # series['training_error'] = DummySeries() |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
159 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
160 series = {} |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
161 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
162 basedir = os.getcwd() |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
163 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
164 h5f = tables.openFile(os.path.join(basedir, "series.h5"), "w") |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
165 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
166 # reconstruction |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
167 reconstruction_base = \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
168 ErrorSeries(error_name="reconstruction_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
169 table_name="reconstruction_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
170 hdf5_file=h5f, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
171 index_names=('epoch','minibatch'), |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
172 title="Reconstruction error (mean over "+str(REDUCE_EVERY)+" minibatches)") |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
173 series['reconstruction_error'] = \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
174 AccumulatorSeriesWrapper(base_series=reconstruction_base, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
175 reduce_every=REDUCE_EVERY) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
176 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
177 # train |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
178 training_base = \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
179 ErrorSeries(error_name="training_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
180 table_name="training_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
181 hdf5_file=h5f, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
182 index_names=('epoch','minibatch'), |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
183 title="Training error (mean over "+str(REDUCE_EVERY)+" minibatches)") |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
184 series['training_error'] = \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
185 AccumulatorSeriesWrapper(base_series=training_base, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
186 reduce_every=REDUCE_EVERY) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
187 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
188 # valid and test are not accumulated/mean, saved directly |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
189 series['validation_error'] = \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
190 ErrorSeries(error_name="validation_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
191 table_name="validation_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
192 hdf5_file=h5f, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
193 index_names=('epoch','minibatch')) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
194 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
195 series['test_error'] = \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
196 ErrorSeries(error_name="test_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
197 table_name="test_error", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
198 hdf5_file=h5f, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
199 index_names=('epoch','minibatch')) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
200 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
201 param_names = [] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
202 for i in range(num_hidden_layers): |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
203 param_names += ['layer%d_W'%i, 'layer%d_b'%i, 'layer%d_bprime'%i] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
204 param_names += ['logreg_layer_W', 'logreg_layer_b'] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
205 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
206 # comment out series we don't want to save |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
207 series['params'] = SharedParamsStatisticsWrapper( |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
208 new_group_name="params", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
209 base_group="/", |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
210 arrays_names=param_names, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
211 hdf5_file=h5f, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
212 index_names=('epoch',)) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
213 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
214 return series |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
215 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
216 # Perform insertion into the Postgre DB based on combination |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
217 # of hyperparameter values above |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
218 # (see comment for produit_cartesien_jobs() to know how it works) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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changeset
|
219 def jobman_insert_nist(): |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
220 jobs = produit_cartesien_jobs(JOB_VALS) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
221 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
222 db = jobman.sql.db(JOBDB) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
223 for job in jobs: |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
224 job.update({jobman.sql.EXPERIMENT: EXPERIMENT_PATH}) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
225 jobman.sql.insert_dict(job, db) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
226 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
227 print "inserted" |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
228 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
229 if __name__ == '__main__': |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
230 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
231 args = sys.argv[1:] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
232 |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
233 #if len(args) > 0 and args[0] == 'load_nist': |
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
234 # test_load_nist() |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
235 |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
236 if len(args) > 0 and args[0] == 'jobman_insert': |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
237 jobman_insert_nist() |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
238 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
239 elif len(args) > 0 and args[0] == 'test_jobman_entrypoint': |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
240 chanmock = DD({'COMPLETE':0,'save':(lambda:None)}) |
250
6d49cf134a40
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
238
diff
changeset
|
241 jobman_entrypoint(DD(DEFAULT_HP_NIST), chanmock) |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
242 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
243 else: |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
244 print "Bad arguments" |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
245 |