ift6266: baseline/mlp/ratio_classes/mlp_nist

annotate baseline/mlp/ratio_classes/mlp_nist_ratio.py @ 452:b0622f78cfec

Add a small paragraph mentionning the distribution differences and a figure illustrating the difference.

author	Arnaud Bergeron <abergeron@gmail.com>
date	Mon, 10 May 2010 13:52:57 -0400
parents	d8129a09ffb1
children

rev	line source
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	1 # -- coding: utf-8 --
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	2 """
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	3 This tutorial introduces the multilayer perceptron using Theano.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	4
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	5 A multilayer perceptron is a logistic regressor where
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	6 instead of feeding the input to the logistic regression you insert a
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	7 intermidiate layer, called the hidden layer, that has a nonlinear
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	8 activation function (usually tanh or sigmoid) . One can use many such
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	9 hidden layers making the architecture deep. The tutorial will also tackle
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	10 the problem of MNIST digit classification.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	11
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	12 .. math::
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	13
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	14 f(x) = G( b^{(2)} + W^{(2)}( s( b^{(1)} + W^{(1)} x))),
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	15
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	16 References:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	17
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	18 - textbooks: "Pattern Recognition and Machine Learning" -
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	19 Christopher M. Bishop, section 5
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	20
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	21 TODO: recommended preprocessing, lr ranges, regularization ranges (explain
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	22 to do lr first, then add regularization)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	23
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	24 """
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	25 __docformat__ = 'restructedtext en'
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	26
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	27 import setup_batches
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	28 import pdb
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	29 import numpy
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	30
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	31 import theano
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	32 import theano.tensor as T
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	33 import time
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	34 import theano.tensor.nnet
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	35 import pylearn
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	36 import theano,pylearn.version
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	37 from pylearn.io import filetensor as ft
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	38
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	39 data_path = '/data/lisa/data/nist/by_class/'
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	40
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	41 class MLP(object):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	42 """Multi-Layer Perceptron Class
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	43
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	44 A multilayer perceptron is a feedforward artificial neural network model
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	45 that has one layer or more of hidden units and nonlinear activations.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	46 Intermidiate layers usually have as activation function thanh or the
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	47 sigmoid function while the top layer is a softamx layer.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	48 """
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9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	51
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	52 def __init__(self, input, n_in, n_hidden, n_out,learning_rate, test_subclass):
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	53 """Initialize the parameters for the multilayer perceptron
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	54
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	55 :param input: symbolic variable that describes the input of the
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	56 architecture (one minibatch)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	57
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	58 :param n_in: number of input units, the dimension of the space in
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	59 which the datapoints lie
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	60
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	61 :param n_hidden: number of hidden units
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	62
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	63 :param n_out: number of output units, the dimension of the space in
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	64 which the labels lie
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	65
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	66 """
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	67
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	68 # initialize the parameters theta = (W1,b1,W2,b2) ; note that this
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	69 # example contains only one hidden layer, but one can have as many
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	70 # layers as he/she wishes, making the network deeper. The only
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	71 # problem making the network deep this way is during learning,
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	72 # backpropagation being unable to move the network from the starting
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	73 # point towards; this is where pre-training helps, giving a good
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	74 # starting point for backpropagation, but more about this in the
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	75 # other tutorials
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	76
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	77 # `W1` is initialized with `W1_values` which is uniformely sampled
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	78 # from -6./sqrt(n_in+n_hidden) and 6./sqrt(n_in+n_hidden)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	79 # the output of uniform if converted using asarray to dtype
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	80 # theano.config.floatX so that the code is runable on GPU
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	81 W1_values = numpy.asarray( numpy.random.uniform( \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	82 low = -numpy.sqrt(6./(n_in+n_hidden)), \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	83 high = numpy.sqrt(6./(n_in+n_hidden)), \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	84 size = (n_in, n_hidden)), dtype = theano.config.floatX)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	85 # `W2` is initialized with `W2_values` which is uniformely sampled
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	86 # from -6./sqrt(n_hidden+n_out) and 6./sqrt(n_hidden+n_out)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	87 # the output of uniform if converted using asarray to dtype
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	88 # theano.config.floatX so that the code is runable on GPU
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	89 W2_values = numpy.asarray( numpy.random.uniform(
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	90 low = -numpy.sqrt(6./(n_hidden+n_out)), \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	91 high= numpy.sqrt(6./(n_hidden+n_out)),\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	92 size= (n_hidden, n_out)), dtype = theano.config.floatX)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	93
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	94 self.W1 = theano.shared( value = W1_values )
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	95 self.b1 = theano.shared( value = numpy.zeros((n_hidden,),
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	96 dtype= theano.config.floatX))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	97 self.W2 = theano.shared( value = W2_values )
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	98 self.b2 = theano.shared( value = numpy.zeros((n_out,),
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	99 dtype= theano.config.floatX))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	100
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	101 #include the learning rate in the classifer so
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	102 #we can modify it on the fly when we want
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	103 lr_value=learning_rate
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	104 self.lr=theano.shared(value=lr_value)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	105 # symbolic expression computing the values of the hidden layer
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	106 self.hidden = T.tanh(T.dot(input, self.W1)+ self.b1)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	107
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	108
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	109
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	110 # symbolic expression computing the values of the top layer
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	111 self.p_y_given_x= T.nnet.softmax(T.dot(self.hidden, self.W2)+self.b2)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	112
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	113 # compute prediction as class whose probability is maximal in
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	114 # symbolic form
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	115 #self.y_pred = T.argmax( self.p_y_given_x, axis =1)
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	116 #self.y_pred_num = T.argmax( self.p_y_given_x[0:9], axis =1)
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	117
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	118 self.test_subclass = test_subclass
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	119
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	120 #if (self.test_subclass == "u"):
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	121 # self.y_pred = T.argmax( self.p_y_given_x[10:35], axis =1) + 10
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	122 #elif (self.test_subclass == "l"):
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	123 # self.y_pred = T.argmax( self.p_y_given_x[35:], axis =1) + 35
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	124 #elif (self.test_subclass == "d"):
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	125 # self.y_pred = T.argmax( self.p_y_given_x[0:9], axis =1)
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	126 #else:
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	127 self.y_pred = T.argmax( self.p_y_given_x, axis =1)
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	128
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	129 # L1 norm ; one regularization option is to enforce L1 norm to
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	130 # be small
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	131 self.L1 = abs(self.W1).sum() + abs(self.W2).sum()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	132
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	133 # square of L2 norm ; one regularization option is to enforce
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	134 # square of L2 norm to be small
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	135 self.L2_sqr = (self.W12).sum() + (self.W22).sum()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	136
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	137
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	138
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	139 def negative_log_likelihood(self, y):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	140 """Return the mean of the negative log-likelihood of the prediction
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	141 of this model under a given target distribution.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	142
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	143 .. math::
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	144
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	145 \frac{1}{\|\mathcal{D}\|}\mathcal{L} (\theta=\{W,b\}, \mathcal{D}) =
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	146 \frac{1}{\|\mathcal{D}\|}\sum_{i=0}^{\|\mathcal{D}\|} \log(P(Y=y^{(i)}\|x^{(i)}, W,b)) \\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	147 \ell (\theta=\{W,b\}, \mathcal{D})
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	148
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	149
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	150 :param y: corresponds to a vector that gives for each example the
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	151 :correct label
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	152 """
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	153 return -T.mean(T.log(self.p_y_given_x)[T.arange(y.shape[0]),y])
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	154
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	155
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	156
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	157
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	158 def errors(self, y):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	159 """Return a float representing the number of errors in the minibatch
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	160 over the total number of examples of the minibatch
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	161 """
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	162
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	163 # check if y has same dimension of y_pred
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	164 if y.ndim != self.y_pred.ndim:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	165 raise TypeError('y should have the same shape as self.y_pred',
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	166 ('y', target.type, 'y_pred', self.y_pred.type))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	167 # check if y is of the correct datatype
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	168 if y.dtype.startswith('int'):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	169 # the T.neq operator returns a vector of 0s and 1s, where 1
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	170 # represents a mistake in prediction
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	171 return T.mean(T.neq(self.y_pred, y))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	172 else:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	173 raise NotImplementedError()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	174
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	175
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	176 def mlp_full_nist( verbose = False,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	177 adaptive_lr = 1,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	178 train_data = 'all/all_train_data.ft',\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	179 train_labels = 'all/all_train_labels.ft',\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	180 test_data = 'all/all_test_data.ft',\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	181 test_labels = 'all/all_test_labels.ft',\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	182 learning_rate=0.5,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	183 L1_reg = 0.00,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	184 L2_reg = 0.0001,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	185 nb_max_exemples=1000000,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	186 batch_size=20,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	187 nb_hidden = 500,\
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	188 nb_targets = 26,\
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	189 tau=1e6,\
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	190 main_class="l",\
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	191 start_ratio=1,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	192 end_ratio=1):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	193
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	194
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	195 configuration = [learning_rate,nb_max_exemples,nb_hidden,adaptive_lr]
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	196
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	197 #save initial learning rate if classical adaptive lr is used
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	198 initial_lr=learning_rate
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	199
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	200 total_validation_error_list = []
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	201 total_train_error_list = []
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	202 learning_rate_list=[]
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	203 best_training_error=float('inf');
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	204
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	205 # set up batches
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	206 batches = setup_batches.Batches()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	207 batches.set_batches(main_class, start_ratio,end_ratio,batch_size,verbose)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	208
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	209 train_batches = batches.get_train_batches()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	210 test_batches = batches.get_test_batches()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	211 validation_batches = batches.get_validation_batches()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	212
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	213 ishape = (32,32) # this is the size of NIST images
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	214
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	215 # allocate symbolic variables for the data
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	216 x = T.fmatrix() # the data is presented as rasterized images
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	217 y = T.lvector() # the labels are presented as 1D vector of
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	218 # [long int] labels
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	219
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	220 if verbose==True:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	221 print 'finished parsing the data'
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	222 # construct the logistic regression class
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	223 classifier = MLP( input=x.reshape((batch_size,32*32)),\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	224 n_in=32*32,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	225 n_hidden=nb_hidden,\
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	226 n_out=nb_targets,\
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	227 learning_rate=learning_rate,\
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	228 test_subclass=main_class)
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	229
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	230
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	231
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	232
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	233 # the cost we minimize during training is the negative log likelihood of
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	234 # the model plus the regularization terms (L1 and L2); cost is expressed
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	235 # here symbolically
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	236 cost = classifier.negative_log_likelihood(y) \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	237 + L1_reg * classifier.L1 \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	238 + L2_reg * classifier.L2_sqr
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	239
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	240 # compiling a theano function that computes the mistakes that are made by
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	241 # the model on a minibatch
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	242 test_model = theano.function([x,y], classifier.errors(y))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	243
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	244 # compute the gradient of cost with respect to theta = (W1, b1, W2, b2)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	245 g_W1 = T.grad(cost, classifier.W1)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	246 g_b1 = T.grad(cost, classifier.b1)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	247 g_W2 = T.grad(cost, classifier.W2)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	248 g_b2 = T.grad(cost, classifier.b2)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	249
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	250 # specify how to update the parameters of the model as a dictionary
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	251 updates = \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	252 { classifier.W1: classifier.W1 - classifier.lr*g_W1 \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	253 , classifier.b1: classifier.b1 - classifier.lr*g_b1 \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	254 , classifier.W2: classifier.W2 - classifier.lr*g_W2 \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	255 , classifier.b2: classifier.b2 - classifier.lr*g_b2 }
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	256
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	257 # compiling a theano function `train_model` that returns the cost, but in
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	258 # the same time updates the parameter of the model based on the rules
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	259 # defined in `updates`
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	260 train_model = theano.function([x, y], cost, updates = updates )
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	261 n_minibatches = len(train_batches)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	262
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	263
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	264
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	265
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	266
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	267
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	268 #conditions for stopping the adaptation:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	269 #1) we have reached nb_max_exemples (this is rounded up to be a multiple of the train size)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	270 #2) validation error is going up twice in a row(probable overfitting)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	271
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	272 # This means we no longer stop on slow convergence as low learning rates stopped
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	273 # too fast.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	274
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	275 # no longer relevant
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	276 patience =nb_max_exemples/batch_size
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	277 patience_increase = 2 # wait this much longer when a new best is
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	278 # found
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	279 improvement_threshold = 0.995 # a relative improvement of this much is
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	280 # considered significant
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	281 validation_frequency = n_minibatches/4
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	282
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	283
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	284
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	285
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	286 best_params = None
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	287 best_validation_loss = float('inf')
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	288 best_iter = 0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	289 test_score = 0.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	290 start_time = time.clock()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	291 n_iter = nb_max_exemples/batch_size # nb of max times we are allowed to run through all exemples
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	292 n_iter = n_iter/n_minibatches + 1 #round up
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	293 n_iter=max(1,n_iter) # run at least once on short debug call
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	294 time_n=0 #in unit of exemples
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	295
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	296 if (main_class == "u"):
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	297 class_offset = 10
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	298 elif (main_class == "l"):
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	299 class_offset = 36
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	300 else:
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	301 class_offset = 0
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	302
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	303
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	304 if verbose == True:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	305 print 'looping at most %d times through the data set' %n_iter
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	306 for iter in xrange(n_iter* n_minibatches):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	307
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	308 # get epoch and minibatch index
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	309 epoch = iter / n_minibatches
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	310 minibatch_index = iter % n_minibatches
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	311
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	312
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	313 if adaptive_lr==2:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	314 classifier.lr.value = tau*initial_lr/(tau+time_n)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	315
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	316 # get the minibatches corresponding to `iter` modulo
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	317 # `len(train_batches)`
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	318 x,y = train_batches[ minibatch_index ]
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	319
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	320 y = y - class_offset
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	321
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	322 # convert to float
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	323 x_float = x/255.0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	324 cost_ij = train_model(x_float,y)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	325
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	326 if (iter+1) % validation_frequency == 0:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	327 # compute zero-one loss on validation set
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	328
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	329 this_validation_loss = 0.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	330 for x,y in validation_batches:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	331 # sum up the errors for each minibatch
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	332 y = y - class_offset
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	333 x_float = x/255.0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	334 this_validation_loss += test_model(x_float,y)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	335 # get the average by dividing with the number of minibatches
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	336 this_validation_loss /= len(validation_batches)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	337 #save the validation loss
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	338 total_validation_error_list.append(this_validation_loss)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	339
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	340 #get the training error rate
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	341 this_train_loss=0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	342 for x,y in train_batches:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	343 # sum up the errors for each minibatch
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	344 y = y - class_offset
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	345 x_float = x/255.0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	346 this_train_loss += test_model(x_float,y)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	347 # get the average by dividing with the number of minibatches
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	348 this_train_loss /= len(train_batches)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	349 #save the validation loss
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	350 total_train_error_list.append(this_train_loss)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	351 if(this_train_loss<best_training_error):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	352 best_training_error=this_train_loss
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	353
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	354 if verbose == True:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	355 print('epoch %i, minibatch %i/%i, validation error %f, training error %f %%' % \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	356 (epoch, minibatch_index+1, n_minibatches, \
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	357 this_validation_loss100.,this_train_loss100))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	358 print 'learning rate = %f' %classifier.lr.value
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	359 print 'time = %i' %time_n
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	360
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	361
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	362 #save the learning rate
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	363 learning_rate_list.append(classifier.lr.value)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	364
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	365
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	366 # if we got the best validation score until now
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	367 if this_validation_loss < best_validation_loss:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	368 # save best validation score and iteration number
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	369 best_validation_loss = this_validation_loss
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	370 best_iter = iter
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	371 # reset patience if we are going down again
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	372 # so we continue exploring
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	373 patience=nb_max_exemples/batch_size
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	374 # test it on the test set
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	375 test_score = 0.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	376 for x,y in test_batches:
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	377 y = y - class_offset
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	378 x_float=x/255.0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	379 test_score += test_model(x_float,y)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	380 test_score /= len(test_batches)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	381 if verbose == True:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	382 print((' epoch %i, minibatch %i/%i, test error of best '
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	383 'model %f %%') %
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	384 (epoch, minibatch_index+1, n_minibatches,
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	385 test_score*100.))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	386
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	387 # if the validation error is going up, we are overfitting (or oscillating)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	388 # stop converging but run at least to next validation
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	389 # to check overfitting or ocsillation
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	390 # the saved weights of the model will be a bit off in that case
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	391 elif this_validation_loss >= best_validation_loss:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	392 #calculate the test error at this point and exit
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	393 # test it on the test set
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	394 # however, if adaptive_lr is true, try reducing the lr to
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	395 # get us out of an oscilliation
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	396 if adaptive_lr==1:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	397 classifier.lr.value=classifier.lr.value/2.0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	398
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	399 test_score = 0.
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	400 #cap the patience so we are allowed one more validation error
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	401 #calculation before aborting
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	402 patience = iter+validation_frequency+1
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	403 for x,y in test_batches:
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	404 y = y - class_offset
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	405 x_float=x/255.0
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	406 test_score += test_model(x_float,y)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	407 test_score /= len(test_batches)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	408 if verbose == True:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	409 print ' validation error is going up, possibly stopping soon'
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	410 print((' epoch %i, minibatch %i/%i, test error of best '
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	411 'model %f %%') %
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	412 (epoch, minibatch_index+1, n_minibatches,
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	413 test_score*100.))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	414
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	415
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	416
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	417
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	418 if iter>patience:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	419 print 'we have diverged'
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	420 break
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	421
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	422
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	423 time_n= time_n + batch_size
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	424 end_time = time.clock()
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	425 if verbose == True:
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	426 print(('Optimization complete. Best validation score of %f %% '
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	427 'obtained at iteration %i, with test performance %f %%') %
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	428 (best_validation_loss * 100., best_iter, test_score*100.))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	429 print ('The code ran for %f minutes' % ((end_time-start_time)/60.))
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	430 print iter
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	431
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	432 #save the model and the weights
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	433 numpy.savez('model.npy', config=configuration, W1=classifier.W1.value,W2=classifier.W2.value, b1=classifier.b1.value,b2=classifier.b2.value)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	434 numpy.savez('results.npy',config=configuration,total_train_error_list=total_train_error_list,total_validation_error_list=total_validation_error_list,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	435 learning_rate_list=learning_rate_list)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	436
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	437 return (best_training_error100.0,best_validation_loss 100.,test_score100.,best_iterbatch_size,(end_time-start_time)/60)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	438
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	439
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	440 if __name__ == '__main__':
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	441 mlp_full_nist(True)
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	442
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	443 def jobman_mlp_full_nist(state,channel):
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	444 (train_error,validation_error,test_error,nb_exemples,time)=mlp_full_nist(learning_rate=state.learning_rate,\
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	445 nb_hidden=state.nb_hidden,\
435 d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	446 main_class=state.main_class,\
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	447 start_ratio=state.ratio,\
d8129a09ffb1 bug fix in output Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: 357 diff changeset	448 end_ratio=state.ratio)
357 9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	449 state.train_error=train_error
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	450 state.validation_error=validation_error
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	451 state.test_error=test_error
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	452 state.nb_exemples=nb_exemples
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	453 state.time=time
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	454 return channel.COMPLETE
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	455
9a7b74927f7d version mlp modifiée pour la selection du ratio de la classe principale Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com> parents: diff changeset	456

Mercurial > ift6266

annotate baseline/mlp/ratio_classes/mlp_nist_ratio.py @ 452:b0622f78cfec