Mercurial > ift6266
annotate deep/stacked_dae/v_sylvain/stacked_dae.py @ 309:60cacb9a70e4
Petits changements pour pouvoir utiliser le GPU
author | SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca> |
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date | Thu, 01 Apr 2010 13:43:43 -0400 |
parents | c77ffb11f91d |
children | 54ad8a091783 |
rev | line source |
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230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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1 #!/usr/bin/python |
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2 # coding: utf-8 |
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3 |
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4 import numpy |
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5 import theano |
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6 import time |
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7 import theano.tensor as T |
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8 from theano.tensor.shared_randomstreams import RandomStreams |
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9 import copy |
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11 from utils import update_locals |
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13 # taken from LeDeepNet/daa.py |
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14 # has a special case when taking log(0) (defined =0) |
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15 # modified to not take the mean anymore |
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16 from theano.tensor.xlogx import xlogx, xlogy0 |
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17 # it's target*log(output) |
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18 def binary_cross_entropy(target, output, sum_axis=1): |
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19 XE = xlogy0(target, output) + xlogy0((1 - target), (1 - output)) |
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20 return -T.sum(XE, axis=sum_axis) |
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22 class LogisticRegression(object): |
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23 def __init__(self, input, n_in, n_out): |
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24 # initialize with 0 the weights W as a matrix of shape (n_in, n_out) |
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25 self.W = theano.shared( value=numpy.zeros((n_in,n_out), |
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26 dtype = theano.config.floatX) ) |
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27 # initialize the baises b as a vector of n_out 0s |
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28 self.b = theano.shared( value=numpy.zeros((n_out,), |
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29 dtype = theano.config.floatX) ) |
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30 # compute vector of class-membership probabilities in symbolic form |
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31 self.p_y_given_x = T.nnet.softmax(T.dot(input, self.W)+self.b) |
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33 # compute prediction as class whose probability is maximal in |
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34 # symbolic form |
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35 self.y_pred=T.argmax(self.p_y_given_x, axis=1) |
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37 # list of parameters for this layer |
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38 self.params = [self.W, self.b] |
280
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
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251
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39 |
230
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40 |
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41 def negative_log_likelihood(self, y): |
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42 return -T.mean(T.log(self.p_y_given_x)[T.arange(y.shape[0]),y]) |
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43 |
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44 def errors(self, y): |
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45 # check if y has same dimension of y_pred |
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46 if y.ndim != self.y_pred.ndim: |
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47 raise TypeError('y should have the same shape as self.y_pred', |
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48 ('y', target.type, 'y_pred', self.y_pred.type)) |
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49 |
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50 # check if y is of the correct datatype |
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51 if y.dtype.startswith('int'): |
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52 # the T.neq operator returns a vector of 0s and 1s, where 1 |
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53 # represents a mistake in prediction |
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54 return T.mean(T.neq(self.y_pred, y)) |
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55 else: |
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56 raise NotImplementedError() |
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57 |
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58 |
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59 class SigmoidalLayer(object): |
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60 def __init__(self, rng, input, n_in, n_out): |
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61 self.input = input |
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63 W_values = numpy.asarray( rng.uniform( \ |
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64 low = -numpy.sqrt(6./(n_in+n_out)), \ |
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65 high = numpy.sqrt(6./(n_in+n_out)), \ |
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66 size = (n_in, n_out)), dtype = theano.config.floatX) |
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67 self.W = theano.shared(value = W_values) |
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69 b_values = numpy.zeros((n_out,), dtype= theano.config.floatX) |
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70 self.b = theano.shared(value= b_values) |
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72 self.output = T.nnet.sigmoid(T.dot(input, self.W) + self.b) |
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73 self.params = [self.W, self.b] |
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77 class dA(object): |
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78 def __init__(self, n_visible= 784, n_hidden= 500, corruption_level = 0.1,\ |
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79 input = None, shared_W = None, shared_b = None): |
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80 self.n_visible = n_visible |
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81 self.n_hidden = n_hidden |
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83 # create a Theano random generator that gives symbolic random values |
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84 theano_rng = RandomStreams() |
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85 |
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86 if shared_W != None and shared_b != None : |
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87 self.W = shared_W |
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88 self.b = shared_b |
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89 else: |
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90 # initial values for weights and biases |
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91 # note : W' was written as `W_prime` and b' as `b_prime` |
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92 |
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parents:
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93 # W is initialized with `initial_W` which is uniformely sampled |
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94 # from -6./sqrt(n_visible+n_hidden) and 6./sqrt(n_hidden+n_visible) |
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95 # the output of uniform if converted using asarray to dtype |
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96 # theano.config.floatX so that the code is runable on GPU |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
97 initial_W = numpy.asarray( numpy.random.uniform( \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
98 low = -numpy.sqrt(6./(n_hidden+n_visible)), \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
99 high = numpy.sqrt(6./(n_hidden+n_visible)), \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
100 size = (n_visible, n_hidden)), dtype = theano.config.floatX) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
101 initial_b = numpy.zeros(n_hidden, dtype = theano.config.floatX) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
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102 |
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changeset
|
103 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
104 # theano shared variables for weights and biases |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
105 self.W = theano.shared(value = initial_W, name = "W") |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
106 self.b = theano.shared(value = initial_b, name = "b") |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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diff
changeset
|
107 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
108 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
109 initial_b_prime= numpy.zeros(n_visible) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
110 # tied weights, therefore W_prime is W transpose |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
111 self.W_prime = self.W.T |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
112 self.b_prime = theano.shared(value = initial_b_prime, name = "b'") |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
113 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
114 # if no input is given, generate a variable representing the input |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
115 if input == None : |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
116 # we use a matrix because we expect a minibatch of several examples, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
117 # each example being a row |
309
60cacb9a70e4
Petits changements pour pouvoir utiliser le GPU
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
280
diff
changeset
|
118 self.x = T.matrix(name = 'input') |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
119 else: |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
120 self.x = input |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
121 # Equation (1) |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
122 # keep 90% of the inputs the same and zero-out randomly selected subset of 10% of the inputs |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
123 # note : first argument of theano.rng.binomial is the shape(size) of |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
124 # random numbers that it should produce |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
125 # second argument is the number of trials |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
126 # third argument is the probability of success of any trial |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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|
127 # |
8a94a5c808cd
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|
128 # this will produce an array of 0s and 1s where 1 has a |
8a94a5c808cd
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diff
changeset
|
129 # probability of 1 - ``corruption_level`` and 0 with |
8a94a5c808cd
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|
130 # ``corruption_level`` |
8a94a5c808cd
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diff
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|
131 self.tilde_x = theano_rng.binomial( self.x.shape, 1, 1 - corruption_level, dtype=theano.config.floatX) * self.x |
8a94a5c808cd
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|
132 # Equation (2) |
8a94a5c808cd
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|
133 # note : y is stored as an attribute of the class so that it can be |
8a94a5c808cd
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diff
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|
134 # used later when stacking dAs. |
8a94a5c808cd
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diff
changeset
|
135 self.y = T.nnet.sigmoid(T.dot(self.tilde_x, self.W ) + self.b) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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diff
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|
136 # Equation (3) |
8a94a5c808cd
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diff
changeset
|
137 #self.z = T.nnet.sigmoid(T.dot(self.y, self.W_prime) + self.b_prime) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
138 # Equation (4) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
139 # note : we sum over the size of a datapoint; if we are using minibatches, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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diff
changeset
|
140 # L will be a vector, with one entry per example in minibatch |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
141 #self.L = - T.sum( self.x*T.log(self.z) + (1-self.x)*T.log(1-self.z), axis=1 ) |
8a94a5c808cd
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diff
changeset
|
142 #self.L = binary_cross_entropy(target=self.x, output=self.z, sum_axis=1) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
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|
143 |
8a94a5c808cd
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diff
changeset
|
144 # bypassing z to avoid running to log(0) |
8a94a5c808cd
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diff
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|
145 z_a = T.dot(self.y, self.W_prime) + self.b_prime |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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|
146 log_sigmoid = T.log(1.) - T.log(1.+T.exp(-z_a)) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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|
147 # log(1-sigmoid(z_a)) |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
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|
148 log_1_sigmoid = -z_a - T.log(1.+T.exp(-z_a)) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
149 self.L = -T.sum( self.x * (log_sigmoid) \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
150 + (1.0-self.x) * (log_1_sigmoid), axis=1 ) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
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151 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
152 # I added this epsilon to avoid getting log(0) and 1/0 in grad |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
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|
153 # This means conceptually that there'd be no probability of 0, but that |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
154 # doesn't seem to me as important (maybe I'm wrong?). |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
155 #eps = 0.00000001 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
156 #eps_1 = 1-eps |
8a94a5c808cd
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff
changeset
|
157 #self.L = - T.sum( self.x * T.log(eps + eps_1*self.z) \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
158 # + (1-self.x)*T.log(eps + eps_1*(1-self.z)), axis=1 ) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
159 # note : L is now a vector, where each element is the cross-entropy cost |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
160 # of the reconstruction of the corresponding example of the |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
161 # minibatch. We need to compute the average of all these to get |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
162 # the cost of the minibatch |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
163 self.cost = T.mean(self.L) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
164 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
165 self.params = [ self.W, self.b, self.b_prime ] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
166 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
167 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
168 class SdA(object): |
251
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
169 def __init__(self, batch_size, n_ins, |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
170 hidden_layers_sizes, n_outs, |
251
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
171 corruption_levels, rng, pretrain_lr, finetune_lr): |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
172 # Just to make sure those are not modified somewhere else afterwards |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
173 hidden_layers_sizes = copy.deepcopy(hidden_layers_sizes) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
174 corruption_levels = copy.deepcopy(corruption_levels) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
175 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
176 update_locals(self, locals()) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
177 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
178 self.layers = [] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
179 self.pretrain_functions = [] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
180 self.params = [] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
181 # MODIF: added this so we also get the b_primes |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
182 # (not used for finetuning... still using ".params") |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
183 self.all_params = [] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
184 self.n_layers = len(hidden_layers_sizes) |
280
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
185 self.logistic_params = [] |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
186 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
187 print "Creating SdA with params:" |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
188 print "batch_size", batch_size |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
189 print "hidden_layers_sizes", hidden_layers_sizes |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
190 print "corruption_levels", corruption_levels |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
191 print "n_ins", n_ins |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
192 print "n_outs", n_outs |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
193 print "pretrain_lr", pretrain_lr |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
194 print "finetune_lr", finetune_lr |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
195 print "----" |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
196 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
197 if len(hidden_layers_sizes) < 1 : |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
198 raiseException (' You must have at least one hidden layer ') |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
199 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
200 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
201 # allocate symbolic variables for the data |
251
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
202 #index = T.lscalar() # index to a [mini]batch |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
203 self.x = T.matrix('x') # the data is presented as rasterized images |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
204 self.y = T.ivector('y') # the labels are presented as 1D vector of |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
205 # [int] labels |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
206 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
207 for i in xrange( self.n_layers ): |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
208 # construct the sigmoidal layer |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
209 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
210 # the size of the input is either the number of hidden units of |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
211 # the layer below or the input size if we are on the first layer |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
212 if i == 0 : |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
213 input_size = n_ins |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
214 else: |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
215 input_size = hidden_layers_sizes[i-1] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
216 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
217 # the input to this layer is either the activation of the hidden |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
218 # layer below or the input of the SdA if you are on the first |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
219 # layer |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
220 if i == 0 : |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
221 layer_input = self.x |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
222 else: |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
223 layer_input = self.layers[-1].output |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
224 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
225 layer = SigmoidalLayer(rng, layer_input, input_size, |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
226 hidden_layers_sizes[i] ) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
227 # add the layer to the |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
228 self.layers += [layer] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
229 self.params += layer.params |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
230 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
231 # Construct a denoising autoencoder that shared weights with this |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
232 # layer |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
233 dA_layer = dA(input_size, hidden_layers_sizes[i], \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
234 corruption_level = corruption_levels[0],\ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
235 input = layer_input, \ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
236 shared_W = layer.W, shared_b = layer.b) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
237 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
238 self.all_params += dA_layer.params |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
239 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
240 # Construct a function that trains this dA |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
241 # compute gradients of layer parameters |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
242 gparams = T.grad(dA_layer.cost, dA_layer.params) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
243 # compute the list of updates |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
244 updates = {} |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
245 for param, gparam in zip(dA_layer.params, gparams): |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
246 updates[param] = param - gparam * pretrain_lr |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
247 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
248 # create a function that trains the dA |
251
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
249 update_fn = theano.function([self.x], dA_layer.cost, \ |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
250 updates = updates)#, |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
251 # givens = { |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
252 # self.x : ensemble}) |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
253 # collect this function into a list |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
254 #update_fn = theano.function([index], dA_layer.cost, \ |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
255 # updates = updates, |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
256 # givens = { |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
257 # self.x : train_set_x[index*batch_size:(index+1)*batch_size] / self.shared_divider}) |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
258 # collect this function into a list |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
259 self.pretrain_functions += [update_fn] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
260 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
261 |
280
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
262 # We now need to add a logistic layer on top of the SDA |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
263 self.logLayer = LogisticRegression(\ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
264 input = self.layers[-1].output,\ |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
265 n_in = hidden_layers_sizes[-1], n_out = n_outs) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
266 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
267 self.params += self.logLayer.params |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
268 self.all_params += self.logLayer.params |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
269 # construct a function that implements one step of finetunining |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
270 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
271 # compute the cost, defined as the negative log likelihood |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
272 cost = self.logLayer.negative_log_likelihood(self.y) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
273 # compute the gradients with respect to the model parameters |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
274 gparams = T.grad(cost, self.params) |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
275 # compute list of updates |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
276 updates = {} |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
277 for param,gparam in zip(self.params, gparams): |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
278 updates[param] = param - gparam*finetune_lr |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
279 |
251
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
280 self.finetune = theano.function([self.x,self.y], cost, |
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
281 updates = updates)#, |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
282 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
283 # symbolic variable that points to the number of errors made on the |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
284 # minibatch given by self.x and self.y |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
285 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
286 self.errors = self.logLayer.errors(self.y) |
251
02b141a466b4
ajout de fonctionnalite pour different finetune dataset
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
235
diff
changeset
|
287 |
280
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
288 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
289 #STRUCTURE FOR THE FINETUNING OF THE LOGISTIC REGRESSION ON THE TOP WITH |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
290 #ALL HIDDEN LAYERS AS INPUT |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
291 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
292 all_h=[] |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
293 for i in xrange(self.n_layers): |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
294 all_h.append(self.layers[i].output) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
295 self.all_hidden=T.concatenate(all_h,axis=1) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
296 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
297 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
298 self.logLayer2 = LogisticRegression(\ |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
299 input = self.all_hidden,\ |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
300 n_in = sum(hidden_layers_sizes), n_out = n_outs) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
301 #n_in=hidden_layers_sizes[0],n_out=n_outs) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
302 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
303 #self.logistic_params+= self.logLayer2.params |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
304 # construct a function that implements one step of finetunining |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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305 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
306 # compute the cost, defined as the negative log likelihood |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
307 cost2 = self.logLayer2.negative_log_likelihood(self.y) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
308 # compute the gradients with respect to the model parameters |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
309 gparams2 = T.grad(cost2, self.logLayer2.params) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
310 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
311 # compute list of updates |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
312 updates2 = {} |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
313 for param,gparam in zip(self.logLayer2.params, gparams2): |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
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changeset
|
314 updates2[param] = param - gparam*finetune_lr |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
315 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
316 self.finetune2 = theano.function([self.x,self.y], cost2, |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
317 updates = updates2) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
318 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
319 # symbolic variable that points to the number of errors made on the |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
320 # minibatch given by self.x and self.y |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
321 |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
322 self.errors2 = self.logLayer2.errors(self.y) |
c77ffb11f91d
rajout de methode reliant toutes les couches cachees a la logistic et changeant seulement les parametres de la logistic durant finetune
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
251
diff
changeset
|
323 |
230
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
324 |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
325 if __name__ == '__main__': |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff
changeset
|
326 import sys |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
|
327 args = sys.argv[1:] |
8a94a5c808cd
Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
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changeset
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328 |