Mercurial > ift6266

annotate deep/stacked_dae/nist_sda.py @ 198:5d88ed99c0af

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Modify the log_reg.py tutorial code to use the datasets module.
author Arnaud Bergeron <abergeron@gmail.com>
date Tue, 02 Mar 2010 18:16:49 -0500
parents 3632e6258642
children e656edaedb48
rev   line source
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
1 #!/usr/bin/python
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
2 # coding: utf-8
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
3
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
4 import ift6266
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
5 import pylearn
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
6
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
7 import numpy
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
8 import theano
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
9 import time
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
10
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
11 import pylearn.version
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
12 import theano.tensor as T
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
13 from theano.tensor.shared_randomstreams import RandomStreams
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
14
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
15 import copy
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
16 import sys
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
17 import os
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
18 import os.path
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
19
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
20 from jobman import DD
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
21 import jobman, jobman.sql
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
22 from pylearn.io import filetensor
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
23
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
24 from utils import produit_croise_jobs
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
25
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
26 from sgd_optimization import SdaSgdOptimizer
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
27
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
28 from ift6266.utils.scalar_series import *
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
29
186
d364a130b221 Ajout du code de base pour scalar_series. Modifications à stacked_dae: réglé un problème avec les input_divider (empêchait une optimisation), et ajouté utilisation des séries. Si j'avais pas déjà commité, aussi, j'ai enlevé l'histoire de réutilisation du pretraining: c'était compliqué (error prone) et ça créait des jobs beaucoup trop longues.
fsavard
parents: 185
diff changeset
30 TEST_CONFIG = False
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
31
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
32 NIST_ALL_LOCATION = '/data/lisa/data/nist/by_class/all'
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
33
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
34 JOBDB = 'postgres://ift6266h10@gershwin/ift6266h10_sandbox_db/fsavard_sda2'
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
35
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
36 REDUCE_TRAIN_TO = None
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
37 MAX_FINETUNING_EPOCHS = 1000
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
38 REDUCE_EVERY = 1000 # number of minibatches before taking means for valid error etc.
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
39 if TEST_CONFIG:
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
40 REDUCE_TRAIN_TO = 1000
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
41 MAX_FINETUNING_EPOCHS = 2
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
42 REDUCE_EVERY = 10
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
43
186
d364a130b221 Ajout du code de base pour scalar_series. Modifications à stacked_dae: réglé un problème avec les input_divider (empêchait une optimisation), et ajouté utilisation des séries. Si j'avais pas déjà commité, aussi, j'ai enlevé l'histoire de réutilisation du pretraining: c'était compliqué (error prone) et ça créait des jobs beaucoup trop longues.
fsavard
parents: 185
diff changeset
44 EXPERIMENT_PATH = "ift6266.deep.stacked_dae.nist_sda.jobman_entrypoint"
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
45
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
46 JOB_VALS = {'pretraining_lr': [0.1, 0.01],#, 0.001],#, 0.0001],
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
47 'pretraining_epochs_per_layer': [10,20],
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
48 'hidden_layers_sizes': [300,800],
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
49 'corruption_levels': [0.1,0.2,0.3],
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
50 'minibatch_size': [20],
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
51 'max_finetuning_epochs':[MAX_FINETUNING_EPOCHS],
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
52 'finetuning_lr':[0.1, 0.01], #0.001 was very bad, so we leave it out
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
53 'num_hidden_layers':[2,3]}
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
54
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
55 # Just useful for tests... minimal number of epochs
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
56 DEFAULT_HP_NIST = DD({'finetuning_lr':0.1,
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
57 'pretraining_lr':0.1,
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
58 'pretraining_epochs_per_layer':20,
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
59 'max_finetuning_epochs':2,
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
60 'hidden_layers_sizes':300,
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
61 'corruption_levels':0.2,
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
62 'minibatch_size':20,
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
63 #'reduce_train_to':300,
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
64 'num_hidden_layers':2})
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
65
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
66 def jobman_entrypoint(state, channel):
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
67 pylearn.version.record_versions(state,[theano,ift6266,pylearn])
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
68 channel.save()
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
69
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
70 workingdir = os.getcwd()
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
71
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
72 print "Will load NIST"
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
73
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
74 nist = NIST(20)
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
75
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
76 print "NIST loaded"
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
77
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
78 rtt = None
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
79 if state.has_key('reduce_train_to'):
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
80 rtt = state['reduce_train_to']
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
81 elif REDUCE_TRAIN_TO:
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
82 rtt = REDUCE_TRAIN_TO
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
83
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
84 if rtt:
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
85 print "Reducing training set to "+str( rtt)+ " examples"
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
86 nist.reduce_train_set(rtt)
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
87
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
88 train,valid,test = nist.get_tvt()
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
89 dataset = (train,valid,test)
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
90
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
91 n_ins = 32*32
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
92 n_outs = 62 # 10 digits, 26*2 (lower, capitals)
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
93
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
94 hls = state.hidden_layers_sizes
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
95 cl = state.corruption_levels
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
96 nhl = state.num_hidden_layers
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
97 state.hidden_layers_sizes = [hls] * nhl
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
98 state.corruption_levels = [cl] * nhl
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
99
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
100 # b,b',W for each hidden layer + b,W of last layer (logreg)
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
101 numparams = nhl * 3 + 2
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
102 series_mux = None
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
103 series_mux = create_series(workingdir, numparams)
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
104
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
105 print "Creating optimizer with state, ", state
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
106
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
107 optimizer = SdaSgdOptimizer(dataset=dataset, hyperparameters=state, \
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
108 n_ins=n_ins, n_outs=n_outs,\
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
109 input_divider=255.0, series_mux=series_mux)
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
110
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
111 optimizer.pretrain()
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
112 channel.save()
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
113
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
114 optimizer.finetune()
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
115 channel.save()
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
116
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
117 pylearn.version.record_versions(state,[theano,ift6266,pylearn])
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
118 channel.save()
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
119
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
120 return channel.COMPLETE
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
121
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
122 def create_series(basedir, numparams):
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
123 mux = SeriesMultiplexer()
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
124
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
125 # comment out series we don't want to save
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
126 mux.add_series(AccumulatorSeries(name="reconstruction_error",
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
127 reduce_every=REDUCE_EVERY, # every 1000 batches, we take the mean and save
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
128 mean=True,
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
129 directory=basedir, flush_every=1))
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
130
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
131 mux.add_series(AccumulatorSeries(name="training_error",
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
132 reduce_every=REDUCE_EVERY, # every 1000 batches, we take the mean and save
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
133 mean=True,
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
134 directory=basedir, flush_every=1))
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
135
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
136 mux.add_series(BaseSeries(name="validation_error", directory=basedir, flush_every=1))
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
137 mux.add_series(BaseSeries(name="test_error", directory=basedir, flush_every=1))
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
138
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
139 mux.add_series(ParamsArrayStats(numparams,name="params",directory=basedir))
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
140
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
141 return mux
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
142
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
143 def jobman_insert_nist():
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
144 jobs = produit_croise_jobs(JOB_VALS)
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
145
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
146 db = jobman.sql.db(JOBDB)
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
147 for job in jobs:
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
148 job.update({jobman.sql.EXPERIMENT: EXPERIMENT_PATH})
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
149 jobman.sql.insert_dict(job, db)
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
150
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
151 print "inserted"
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
152
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
153 class NIST:
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
154 def __init__(self, minibatch_size, basepath=None, reduce_train_to=None):
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
155 global NIST_ALL_LOCATION
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
156
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
157 self.minibatch_size = minibatch_size
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
158 self.basepath = basepath and basepath or NIST_ALL_LOCATION
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
159
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
160 self.set_filenames()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
161
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
162 # arrays of 2 elements: .x, .y
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
163 self.train = [None, None]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
164 self.test = [None, None]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
165
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
166 self.load_train_test()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
167
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
168 self.valid = [[], []]
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
169 self.split_train_valid()
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
170 if reduce_train_to:
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
171 self.reduce_train_set(reduce_train_to)
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
172
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
173 def get_tvt(self):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
174 return self.train, self.valid, self.test
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
175
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
176 def set_filenames(self):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
177 self.train_files = ['all_train_data.ft',
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
178 'all_train_labels.ft']
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
179
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
180 self.test_files = ['all_test_data.ft',
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
181 'all_test_labels.ft']
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
182
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
183 def load_train_test(self):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
184 self.load_data_labels(self.train_files, self.train)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
185 self.load_data_labels(self.test_files, self.test)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
186
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
187 def load_data_labels(self, filenames, pair):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
188 for i, fn in enumerate(filenames):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
189 f = open(os.path.join(self.basepath, fn))
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
190 pair[i] = filetensor.read(f)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
191 f.close()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
192
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
193 def reduce_train_set(self, max):
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
194 self.train[0] = self.train[0][:max]
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
195 self.train[1] = self.train[1][:max]
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
196
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
197 if max < len(self.test[0]):
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
198 for ar in (self.test, self.valid):
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
199 ar[0] = ar[0][:max]
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
200 ar[1] = ar[1][:max]
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
201
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
202 def split_train_valid(self):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
203 test_len = len(self.test[0])
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
204
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
205 new_train_x = self.train[0][:-test_len]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
206 new_train_y = self.train[1][:-test_len]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
207
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
208 self.valid[0] = self.train[0][-test_len:]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
209 self.valid[1] = self.train[1][-test_len:]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
210
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
211 self.train[0] = new_train_x
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
212 self.train[1] = new_train_y
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
213
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
214 def test_load_nist():
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
215 print "Will load NIST"
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
216
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
217 import time
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
218 t1 = time.time()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
219 nist = NIST(20)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
220 t2 = time.time()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
221
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
222 print "NIST loaded. time delta = ", t2-t1
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
223
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
224 tr,v,te = nist.get_tvt()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
225
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
226 print "Lenghts: ", len(tr[0]), len(v[0]), len(te[0])
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
227
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
228 raw_input("Press any key")
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
229
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
230 # hp for hyperparameters
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
231 def sgd_optimization_nist(hp=None, dataset_dir='/data/lisa/data/nist'):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
232 global DEFAULT_HP_NIST
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
233 hp = hp and hp or DEFAULT_HP_NIST
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
234
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
235 print "Will load NIST"
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
236
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
237 import time
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
238 t1 = time.time()
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
239 nist = NIST(20, reduce_train_to=100)
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
240 t2 = time.time()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
241
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
242 print "NIST loaded. time delta = ", t2-t1
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
243
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
244 train,valid,test = nist.get_tvt()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
245 dataset = (train,valid,test)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
246
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
247 print train[0][15]
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
248 print type(train[0][1])
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
249
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
250
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
251 print "Lengths train, valid, test: ", len(train[0]), len(valid[0]), len(test[0])
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
252
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
253 n_ins = 32*32
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
254 n_outs = 62 # 10 digits, 26*2 (lower, capitals)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
255
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
256 optimizer = SdaSgdOptimizer(dataset, hp, n_ins, n_outs, input_divider=255.0)
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
257 optimizer.train()
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
258
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
259 if __name__ == '__main__':
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
260
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
261 import sys
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
262
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
263 args = sys.argv[1:]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
264
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
265 if len(args) > 0 and args[0] == 'load_nist':
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
266 test_load_nist()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
267
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
268 elif len(args) > 0 and args[0] == 'jobman_insert':
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
269 jobman_insert_nist()
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
270
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
271 elif len(args) > 0 and args[0] == 'test_jobman_entrypoint':
191
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
272 def f():
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
273 pass
3632e6258642 Ajouts mineurs à stacked_dae, juste printé l'heure je crois.
fsavard
parents: 186
diff changeset
274 chanmock = DD({'COMPLETE':0,'save':f})
185
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
275 jobman_entrypoint(DEFAULT_HP_NIST, chanmock)
b9ea8e2d071a Enlevé ce qui concernait la réutilisation de résultats de préentraînement (trop compliqué pour peu de bénéfice: c'est le finetuning qui est vraiment long
fsavard
parents: 167
diff changeset
276
139
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
277 elif len(args) > 0 and args[0] == 'estimate':
7d8366fb90bf Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents: 131
diff changeset
278 estimate_total_time()
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
279 else:
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
280 sgd_optimization_nist()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
281