Mercurial > ift6266

annotate scripts/setup_batches.py @ 340:523e7b87c521

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Corrected a few bugs, no new features. Supposedly ready to run on cluster.
author fsavard
date Sun, 18 Apr 2010 11:39:24 -0400
parents 5b260cc8f477
children 7bc555cc9aab b0741ea3ff6f
rev   line source
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
1 # -*- coding: utf-8 -*-
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
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diff changeset
2
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
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diff changeset
3 import random
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
4 from numpy import *
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
5 from pylearn.io import filetensor as ft
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
6
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
7 class Batches():
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
8 def __init__(self):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
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9 data_path = '/data/lisa/data/nist/by_class/'
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
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10
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
11 digits_train_data = 'digits/digits_train_data.ft'
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
12 digits_train_labels = 'digits/digits_train_labels.ft'
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
13 digits_test_data = 'digits/digits_test_data.ft'
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
14 digits_test_labels = 'digits/digits_test_labels.ft'
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
15
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
16 lower_train_data = 'lower/lower_train_data.ft'
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
17 lower_train_labels = 'lower/lower_train_labels.ft'
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
18 upper_train_data = 'upper/upper_train_data.ft'
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
19 upper_train_labels = 'upper/upper_train_labels.ft'
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
20 test_data = 'all/all_test_data.ft'
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
21 test_labels = 'all/all_test_labels.ft'
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
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diff changeset
22
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
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diff changeset
23 print 'Opening data...'
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
24
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
25 f_digits_train_data = open(data_path + digits_train_data)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
26 f_digits_train_labels = open(data_path + digits_train_labels)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
27 f_digits_test_data = open(data_path + digits_test_data)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
28 f_digits_test_labels = open(data_path + digits_test_labels)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
29
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
30 f_lower_train_data = open(data_path + lower_train_data)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
31 f_lower_train_labels = open(data_path + lower_train_labels)
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
32 f_upper_train_data = open(data_path + upper_train_data)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
33 f_upper_train_labels = open(data_path + upper_train_labels)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
34
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
35 f_test_data = open(data_path + test_data)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
36 f_test_labels = open(data_path + test_labels)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
37
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
38 self.raw_digits_train_data = ft.read(f_digits_train_data)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
39 self.raw_digits_train_labels = ft.read(f_digits_train_labels)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
40 self.raw_digits_test_data = ft.read(f_digits_test_data)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
41 self.raw_digits_test_labels = ft.read(f_digits_test_labels)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
42
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
43 self.raw_lower_train_data = ft.read(f_lower_train_data)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
44 self.raw_lower_train_labels = ft.read(f_lower_train_labels)
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
45 self.raw_upper_train_data = ft.read(f_upper_train_data)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
46 self.raw_upper_train_labels = ft.read(f_upper_train_labels)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
47
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
48 self.raw_test_data = ft.read(f_test_data)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
49 self.raw_test_labels = ft.read(f_test_labels)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
50
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
51 f_digits_train_data.close()
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
52 f_digits_train_labels.close()
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
53 f_digits_test_data.close()
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
54 f_digits_test_labels.close()
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
55
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
56 f_lower_train_data.close()
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
57 f_lower_train_labels.close()
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
58 f_upper_train_data.close()
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
59 f_upper_train_labels.close()
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
60
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
61 f_test_data.close()
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
62 f_test_labels.close()
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
63
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
64 print 'Data opened'
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
65
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
66 def set_batches(self, start_ratio = -1, end_ratio = -1, batch_size = 20, verbose = False):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
67 self.batch_size = batch_size
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
68
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
69 digits_train_size = len(self.raw_digits_train_labels)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
70 digits_test_size = len(self.raw_digits_test_labels)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
71
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
72 lower_train_size = len(self.raw_lower_train_labels)
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
73 upper_train_size = len(self.raw_upper_train_labels)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
74
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
75 if verbose == True:
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
76 print 'digits_train_size = %d' %digits_train_size
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
77 print 'digits_test_size = %d' %digits_test_size
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
78 print 'lower_train_size = %d' %lower_train_size
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
79 print 'upper_train_size = %d' %upper_train_size
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
80
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
81 # define main and other datasets
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
82 raw_main_train_data = self.raw_digits_train_data
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
83 raw_other_train_data1 = self.raw_lower_train_labels
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
84 raw_other_train_data2 = self.raw_upper_train_labels
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
85 raw_test_data = self.raw_digits_test_data
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
86 #raw_test_data = self.raw_test_data
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
87
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
88 raw_main_train_labels = self.raw_digits_train_labels
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
89 raw_other_train_labels1 = self.raw_lower_train_labels
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
90 raw_other_train_labels2 = self.raw_upper_train_labels
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
91 raw_test_labels = self.raw_digits_test_labels
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
92 #raw_test_labels = self.raw_test_labels
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
93
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
94 main_train_size = len(raw_main_train_labels)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
95 other_train_size1 = len(raw_other_train_labels1)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
96 other_train_size2 = len(raw_other_train_labels2)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
97 other_train_size = other_train_size1 + other_train_size2
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
98
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
99 test_size = len(raw_test_labels)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
100 test_size = int(test_size/batch_size)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
101 test_size *= batch_size
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
102 validation_size = test_size
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
103
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
104 # default ratio is actual ratio
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
105 if start_ratio == -1:
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
106 self.start_ratio = float(main_train_size - test_size) / float(main_train_size + other_train_size)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
107 else:
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
108 self.start_ratio = start_ratio
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
109
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
110 if start_ratio == -1:
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
111 self.end_ratio = float(main_train_size - test_size) / float(main_train_size + other_train_size)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
112 else:
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
113 self.end_ratio = end_ratio
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
114
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
115 if verbose == True:
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
116 print 'start_ratio = %f' %self.start_ratio
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
117 print 'end_ratio = %f' %self.end_ratio
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
118
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
119 i_main = 0
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
120 i_other1 = 0
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
121 i_other2 = 0
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
122 i_batch = 0
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
123
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
124 # compute the number of batches given start and end ratios
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
125 n_main_batch = (main_train_size - test_size - batch_size * (self.end_ratio - self.start_ratio) / 2 ) / (batch_size * (self.start_ratio + (self.end_ratio - self.start_ratio) / 2))
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
126 if (batch_size != batch_size * (self.start_ratio + (self.end_ratio - self.start_ratio) / 2)):
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
127 n_other_batch = (other_train_size - batch_size * (self.end_ratio - self.start_ratio) / 2 ) / (batch_size - batch_size * (self.start_ratio + (self.end_ratio - self.start_ratio) / 2))
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
128 else:
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
129 n_other_batch = n_main_batch
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
130
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
131 n_batches = min([n_main_batch, n_other_batch])
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
132
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
133 # train batches
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
134 self.train_batches = []
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
135
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
136 # as long as we have data left in main and other, we create batches
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
137 while i_main < main_train_size - batch_size - test_size and i_other1 < other_train_size1 - batch_size and i_other2 < other_train_size2 - batch_size:
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
138 ratio = self.start_ratio + i_batch * (self.end_ratio - self.start_ratio) / n_batches
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
139 batch_data = copy(raw_main_train_data[0:self.batch_size])
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
140 batch_labels = copy(raw_main_train_labels[0:self.batch_size])
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
141
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
142 for i in xrange(0, self.batch_size): # randomly choose between main and other, given the current ratio
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
143 rnd1 = random.randint(0, 100)
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
144
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
145 if rnd1 < 100 * ratio:
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
146 batch_data[i] = raw_main_train_data[i_main]
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
147 batch_labels[i] = raw_main_train_labels[i_main]
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
148 i_main += 1
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
149 else:
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
150 rnd2 = random.randint(0, 100)
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
151
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
152 if rnd2 < 100 * float(other_train_size1) / float(other_train_size):
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
153 batch_data[i] = raw_other_train_data1[i_other1]
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
154 batch_labels[i] = raw_other_train_labels1[i_other1]
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
155 i_other1 += 1
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
156 else:
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
157 batch_data[i] = raw_other_train_data2[i_other2]
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
158 batch_labels[i] = raw_other_train_labels2[i_other2]
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
159 i_other2 += 1
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
160
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
161 self.train_batches = self.train_batches + \
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
162 [(batch_data, batch_labels)]
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
163 i_batch += 1
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
164
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
165 offset = i_main
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
166
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
167 # test batches
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
168 self.test_batches = []
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
169 for i in xrange(0, test_size, batch_size):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
170 self.test_batches = self.test_batches + \
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
171 [(raw_test_data[i:i+batch_size], raw_test_labels[i:i+batch_size])]
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
172
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
173 # validation batches
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
174 self.validation_batches = []
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
175 for i in xrange(0, validation_size, batch_size):
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
176 self.validation_batches = self.validation_batches + \
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
177 [(raw_main_train_data[offset+i:offset+i+batch_size], raw_main_train_labels[offset+i:offset+i+batch_size])]
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
178
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
179 if verbose == True:
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
180 print 'n_main = %d' %i_main
332
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
181 print 'n_other1 = %d' %i_other1
5b260cc8f477 Correction de bug numpy array et ajout d'une deuxième classe auxiliaire
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 295
diff changeset
182 print 'n_other2 = %d' %i_other2
295
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
183 print 'nb_train_batches = %d / %d' %(i_batch,n_batches)
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
184 print 'offset = %d' %offset
a6b6b1140de9 modifié setup_batches.py pour compatibilité avec mlp_nist.py
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents: 272
diff changeset
185
272
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
186 def get_train_batches(self):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
187 return self.train_batches
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
188
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
189 def get_test_batches(self):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
190 return self.test_batches
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
191
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
192 def get_validation_batches(self):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
193 return self.validation_batches
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
194
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
195 def test_set_batches(self, intervall = 1000):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
196 for i in xrange(0, len(self.train_batches) - self.batch_size, intervall):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
197 n_main = 0
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
198
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
199 for j in xrange(0, self.batch_size):
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
200 if self.train_batches[i][1][j] < 10:
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
201 n_main +=1
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
202 print 'ratio batch %d : %f' %(i,float(n_main) / float(self.batch_size))
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
203
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
204 if __name__ == '__main__':
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
205 batches = Batches()
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
206 batches.set_batches(0.5,1, 20, True)
f6d9b6b89c2a ajouté : module de préparation de batches en fonction d'un ratio de classes
Guillaume Sicard <guitch21@gmail.com>
parents:
diff changeset
207 batches.test_set_batches()