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annotate scripts/stacked_dae/sgd_optimization.py @ 134:4981c729149c

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Fixed various bugs in pipeline for Python 2.5 support
author boulanni <nicolas_boulanger@hotmail.com>
date Sat, 20 Feb 2010 02:09:09 -0500
parents 5c79a2557f2f
children 7d8366fb90bf
rev   line source
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
1 #!/usr/bin/python
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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2 # coding: utf-8
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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3
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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4 # Generic SdA optimization loop, adapted slightly from the deeplearning.net tutorial
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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5
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6 import numpy
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7 import theano
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8 import time
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9 import theano.tensor as T
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10
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11 from jobman import DD
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12
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13 from stacked_dae import SdA
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14
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15 def sgd_optimization(dataset, hyperparameters, n_ins, n_outs):
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16 hp = hyperparameters
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17
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18 printout_frequency = 1000
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19
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20 train_set, valid_set, test_set = dataset
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21
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22 def shared_dataset(data_xy):
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23 data_x, data_y = data_xy
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24 shared_x = theano.shared(numpy.asarray(data_x, dtype=theano.config.floatX))
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25 shared_y = theano.shared(numpy.asarray(data_y, dtype=theano.config.floatX))
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26 return shared_x, T.cast(shared_y, 'int32')
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27
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28 test_set_x, test_set_y = shared_dataset(test_set)
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29 valid_set_x, valid_set_y = shared_dataset(valid_set)
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30 train_set_x, train_set_y = shared_dataset(train_set)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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31
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32 # compute number of minibatches for training, validation and testing
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33 n_train_batches = train_set_x.value.shape[0] / hp.minibatch_size
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34 n_valid_batches = valid_set_x.value.shape[0] / hp.minibatch_size
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35 n_test_batches = test_set_x.value.shape[0] / hp.minibatch_size
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36
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37 # allocate symbolic variables for the data
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38 index = T.lscalar() # index to a [mini]batch
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39
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40 # construct the stacked denoising autoencoder class
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41 classifier = SdA( train_set_x=train_set_x, train_set_y = train_set_y,\
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42 batch_size = hp.minibatch_size, n_ins= n_ins, \
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43 hidden_layers_sizes = hp.hidden_layers_sizes, n_outs=10, \
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44 corruption_levels = hp.corruption_levels,\
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45 rng = numpy.random.RandomState(1234),\
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46 pretrain_lr = hp.pretraining_lr, finetune_lr = hp.finetuning_lr )
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47
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48 printout_acc = 0.0
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49
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50 start_time = time.clock()
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51 ## Pre-train layer-wise
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52 for i in xrange(classifier.n_layers):
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53 # go through pretraining epochs
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54 for epoch in xrange(hp.pretraining_epochs_per_layer):
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55 # go through the training set
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56 for batch_index in xrange(n_train_batches):
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57 c = classifier.pretrain_functions[i](batch_index)
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58
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59 print c
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60
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61 printout_acc += c / printout_frequency
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62 if (batch_index+1) % printout_frequency == 0:
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63 print batch_index, "reconstruction cost avg=", printout_acc
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diff changeset
64 printout_acc = 0.0
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65
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66 print 'Pre-training layer %i, epoch %d, cost '%(i,epoch),c
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67
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68 end_time = time.clock()
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69
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70 print ('Pretraining took %f minutes' %((end_time-start_time)/60.))
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71 # Fine-tune the entire model
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72
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73 minibatch_size = hp.minibatch_size
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74
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75 # create a function to compute the mistakes that are made by the model
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76 # on the validation set, or testing set
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77 test_model = theano.function([index], classifier.errors,
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parents:
diff changeset
78 givens = {
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79 classifier.x: test_set_x[index*minibatch_size:(index+1)*minibatch_size],
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diff changeset
80 classifier.y: test_set_y[index*minibatch_size:(index+1)*minibatch_size]})
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parents:
diff changeset
81
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parents:
diff changeset
82 validate_model = theano.function([index], classifier.errors,
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
83 givens = {
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
84 classifier.x: valid_set_x[index*minibatch_size:(index+1)*minibatch_size],
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
85 classifier.y: valid_set_y[index*minibatch_size:(index+1)*minibatch_size]})
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
86
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
87
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
88 # early-stopping parameters
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parents:
diff changeset
89 patience = 10000 # look as this many examples regardless
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parents:
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90 patience_increase = 2. # wait this much longer when a new best is
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parents:
diff changeset
91 # found
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parents:
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92 improvement_threshold = 0.995 # a relative improvement of this much is
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diff changeset
93 # considered significant
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diff changeset
94 validation_frequency = min(n_train_batches, patience/2)
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parents:
diff changeset
95 # go through this many
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
96 # minibatche before checking the network
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
97 # on the validation set; in this case we
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
98 # check every epoch
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
99
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
100 best_params = None
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
101 best_validation_loss = float('inf')
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
102 test_score = 0.
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
103 start_time = time.clock()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
104
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
105 done_looping = False
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
106 epoch = 0
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
107
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
108 printout_acc = 0.0
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
109
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
110 print "----- START FINETUNING -----"
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
111
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
112 while (epoch < hp.max_finetuning_epochs) and (not done_looping):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
113 epoch = epoch + 1
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
114 for minibatch_index in xrange(n_train_batches):
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
115
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
116 cost_ij = classifier.finetune(minibatch_index)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
117 iter = epoch * n_train_batches + minibatch_index
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
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parents:
diff changeset
118
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
119 printout_acc += cost_ij / float(printout_frequency * minibatch_size)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
120 if (iter+1) % printout_frequency == 0:
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
121 print iter, "cost avg=", printout_acc
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
122 printout_acc = 0.0
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
123
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
124 if (iter+1) % validation_frequency == 0:
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
125
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
126 validation_losses = [validate_model(i) for i in xrange(n_valid_batches)]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
127 this_validation_loss = numpy.mean(validation_losses)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
128 print('epoch %i, minibatch %i/%i, validation error %f %%' % \
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
129 (epoch, minibatch_index+1, n_train_batches, \
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
130 this_validation_loss*100.))
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
131
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
132
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
133 # if we got the best validation score until now
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
134 if this_validation_loss < best_validation_loss:
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
135
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
136 #improve patience if loss improvement is good enough
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
137 if this_validation_loss < best_validation_loss * \
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
138 improvement_threshold :
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
139 patience = max(patience, iter * patience_increase)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
140
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
141 # save best validation score and iteration number
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
142 best_validation_loss = this_validation_loss
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
143 best_iter = iter
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
144
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
145 # test it on the test set
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
146 test_losses = [test_model(i) for i in xrange(n_test_batches)]
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
147 test_score = numpy.mean(test_losses)
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
148 print((' epoch %i, minibatch %i/%i, test error of best '
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
149 'model %f %%') %
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
150 (epoch, minibatch_index+1, n_train_batches,
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
151 test_score*100.))
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
152
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
153
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
154 if patience <= iter :
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
155 done_looping = True
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
156 break
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
157
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
158 end_time = time.clock()
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
159 print(('Optimization complete with best validation score of %f %%,'
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
160 'with test performance %f %%') %
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
161
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
162 (best_validation_loss * 100., test_score*100.))
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
163 print ('The code ran for %f minutes' % ((end_time-start_time)/60.))
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
164
5c79a2557f2f Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff changeset
165