Mercurial > ift6266
annotate scripts/stacked_dae/stacked_dae.py @ 140:29fd19d67026
Ajoutés fichiers oubliés pour previous commit.
author | fsavard |
---|---|
date | Mon, 22 Feb 2010 13:39:35 -0500 |
parents | 7d8366fb90bf |
children |
rev | line source |
---|---|
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
1 #!/usr/bin/python |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
2 # coding: utf-8 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
3 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
4 import numpy |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
5 import theano |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
6 import time |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
7 import theano.tensor as T |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
8 from theano.tensor.shared_randomstreams import RandomStreams |
139
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
9 import copy |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
10 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
11 from utils import update_locals |
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
12 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
13 class LogisticRegression(object): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
14 def __init__(self, input, n_in, n_out): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
15 # initialize with 0 the weights W as a matrix of shape (n_in, n_out) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
16 self.W = theano.shared( value=numpy.zeros((n_in,n_out), |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
17 dtype = theano.config.floatX) ) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
18 # initialize the baises b as a vector of n_out 0s |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
19 self.b = theano.shared( value=numpy.zeros((n_out,), |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
20 dtype = theano.config.floatX) ) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
21 # compute vector of class-membership probabilities in symbolic form |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
22 self.p_y_given_x = T.nnet.softmax(T.dot(input, self.W)+self.b) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
23 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
24 # compute prediction as class whose probability is maximal in |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
25 # symbolic form |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
26 self.y_pred=T.argmax(self.p_y_given_x, axis=1) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
27 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
28 # list of parameters for this layer |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
29 self.params = [self.W, self.b] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
30 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
31 def negative_log_likelihood(self, y): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
32 return -T.mean(T.log(self.p_y_given_x)[T.arange(y.shape[0]),y]) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
33 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
34 def errors(self, y): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
35 # check if y has same dimension of y_pred |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
36 if y.ndim != self.y_pred.ndim: |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
37 raise TypeError('y should have the same shape as self.y_pred', |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
38 ('y', target.type, 'y_pred', self.y_pred.type)) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
39 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
40 # check if y is of the correct datatype |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
41 if y.dtype.startswith('int'): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
42 # the T.neq operator returns a vector of 0s and 1s, where 1 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
43 # represents a mistake in prediction |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
44 return T.mean(T.neq(self.y_pred, y)) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
45 else: |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
46 raise NotImplementedError() |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
47 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
48 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
49 class SigmoidalLayer(object): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
50 def __init__(self, rng, input, n_in, n_out): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
51 self.input = input |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
52 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
53 W_values = numpy.asarray( rng.uniform( \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
54 low = -numpy.sqrt(6./(n_in+n_out)), \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
55 high = numpy.sqrt(6./(n_in+n_out)), \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
56 size = (n_in, n_out)), dtype = theano.config.floatX) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
57 self.W = theano.shared(value = W_values) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
58 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
59 b_values = numpy.zeros((n_out,), dtype= theano.config.floatX) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
60 self.b = theano.shared(value= b_values) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
61 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
62 self.output = T.nnet.sigmoid(T.dot(input, self.W) + self.b) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
63 self.params = [self.W, self.b] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
64 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
65 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
66 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
67 class dA(object): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
68 def __init__(self, n_visible= 784, n_hidden= 500, corruption_level = 0.1,\ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
69 input = None, shared_W = None, shared_b = None): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
70 self.n_visible = n_visible |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
71 self.n_hidden = n_hidden |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
72 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
73 # create a Theano random generator that gives symbolic random values |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
74 theano_rng = RandomStreams() |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
75 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
76 if shared_W != None and shared_b != None : |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
77 self.W = shared_W |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
78 self.b = shared_b |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
79 else: |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
80 # initial values for weights and biases |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
81 # note : W' was written as `W_prime` and b' as `b_prime` |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
82 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
83 # W is initialized with `initial_W` which is uniformely sampled |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
84 # from -6./sqrt(n_visible+n_hidden) and 6./sqrt(n_hidden+n_visible) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
85 # the output of uniform if converted using asarray to dtype |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
86 # theano.config.floatX so that the code is runable on GPU |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
87 initial_W = numpy.asarray( numpy.random.uniform( \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
88 low = -numpy.sqrt(6./(n_hidden+n_visible)), \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
89 high = numpy.sqrt(6./(n_hidden+n_visible)), \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
90 size = (n_visible, n_hidden)), dtype = theano.config.floatX) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
91 initial_b = numpy.zeros(n_hidden, dtype = theano.config.floatX) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
92 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
93 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
94 # theano shared variables for weights and biases |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
95 self.W = theano.shared(value = initial_W, name = "W") |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
96 self.b = theano.shared(value = initial_b, name = "b") |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
97 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
98 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
99 initial_b_prime= numpy.zeros(n_visible) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
100 # tied weights, therefore W_prime is W transpose |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
101 self.W_prime = self.W.T |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
102 self.b_prime = theano.shared(value = initial_b_prime, name = "b'") |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
103 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
104 # if no input is given, generate a variable representing the input |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
105 if input == None : |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
106 # we use a matrix because we expect a minibatch of several examples, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
107 # each example being a row |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
108 self.x = T.dmatrix(name = 'input') |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
109 else: |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
110 self.x = input |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
111 # Equation (1) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
112 # keep 90% of the inputs the same and zero-out randomly selected subset of 10% of the inputs |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
113 # note : first argument of theano.rng.binomial is the shape(size) of |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
114 # random numbers that it should produce |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
115 # second argument is the number of trials |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
116 # third argument is the probability of success of any trial |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
117 # |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
118 # this will produce an array of 0s and 1s where 1 has a |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
119 # probability of 1 - ``corruption_level`` and 0 with |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
120 # ``corruption_level`` |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
121 self.tilde_x = theano_rng.binomial( self.x.shape, 1, 1 - corruption_level) * self.x |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
122 # Equation (2) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
123 # note : y is stored as an attribute of the class so that it can be |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
124 # used later when stacking dAs. |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
125 self.y = T.nnet.sigmoid(T.dot(self.tilde_x, self.W ) + self.b) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
126 # Equation (3) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
127 self.z = T.nnet.sigmoid(T.dot(self.y, self.W_prime) + self.b_prime) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
128 # Equation (4) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
129 # note : we sum over the size of a datapoint; if we are using minibatches, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
130 # L will be a vector, with one entry per example in minibatch |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
131 self.L = - T.sum( self.x*T.log(self.z) + (1-self.x)*T.log(1-self.z), axis=1 ) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
132 # note : L is now a vector, where each element is the cross-entropy cost |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
133 # of the reconstruction of the corresponding example of the |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
134 # minibatch. We need to compute the average of all these to get |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
135 # the cost of the minibatch |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
136 self.cost = T.mean(self.L) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
137 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
138 self.params = [ self.W, self.b, self.b_prime ] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
139 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
140 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
141 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
142 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
143 class SdA(object): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
144 def __init__(self, train_set_x, train_set_y, batch_size, n_ins, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
145 hidden_layers_sizes, n_outs, |
139
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
146 corruption_levels, rng, pretrain_lr, finetune_lr, input_divider=1.0): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
147 update_locals(self, locals()) |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
148 |
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
149 self.layers = [] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
150 self.pretrain_functions = [] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
151 self.params = [] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
152 self.n_layers = len(hidden_layers_sizes) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
153 |
139
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
154 self.input_divider = numpy.asarray(input_divider, dtype=theano.config.floatX) |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
155 |
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
156 if len(hidden_layers_sizes) < 1 : |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
157 raiseException (' You must have at least one hidden layer ') |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
158 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
159 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
160 # allocate symbolic variables for the data |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
161 index = T.lscalar() # index to a [mini]batch |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
162 self.x = T.matrix('x') # the data is presented as rasterized images |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
163 self.y = T.ivector('y') # the labels are presented as 1D vector of |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
164 # [int] labels |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
165 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
166 for i in xrange( self.n_layers ): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
167 # construct the sigmoidal layer |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
168 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
169 # the size of the input is either the number of hidden units of |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
170 # the layer below or the input size if we are on the first layer |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
171 if i == 0 : |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
172 input_size = n_ins |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
173 else: |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
174 input_size = hidden_layers_sizes[i-1] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
175 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
176 # the input to this layer is either the activation of the hidden |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
177 # layer below or the input of the SdA if you are on the first |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
178 # layer |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
179 if i == 0 : |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
180 layer_input = self.x |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
181 else: |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
182 layer_input = self.layers[-1].output |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
183 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
184 layer = SigmoidalLayer(rng, layer_input, input_size, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
185 hidden_layers_sizes[i] ) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
186 # add the layer to the |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
187 self.layers += [layer] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
188 self.params += layer.params |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
189 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
190 # Construct a denoising autoencoder that shared weights with this |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
191 # layer |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
192 dA_layer = dA(input_size, hidden_layers_sizes[i], \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
193 corruption_level = corruption_levels[0],\ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
194 input = layer_input, \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
195 shared_W = layer.W, shared_b = layer.b) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
196 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
197 # Construct a function that trains this dA |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
198 # compute gradients of layer parameters |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
199 gparams = T.grad(dA_layer.cost, dA_layer.params) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
200 # compute the list of updates |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
201 updates = {} |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
202 for param, gparam in zip(dA_layer.params, gparams): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
203 updates[param] = param - gparam * pretrain_lr |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
204 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
205 # create a function that trains the dA |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
206 update_fn = theano.function([index], dA_layer.cost, \ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
207 updates = updates, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
208 givens = { |
139
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
209 self.x : train_set_x[index*batch_size:(index+1)*batch_size] / self.input_divider}) |
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
210 # collect this function into a list |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
211 self.pretrain_functions += [update_fn] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
212 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
213 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
214 # We now need to add a logistic layer on top of the MLP |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
215 self.logLayer = LogisticRegression(\ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
216 input = self.layers[-1].output,\ |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
217 n_in = hidden_layers_sizes[-1], n_out = n_outs) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
218 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
219 self.params += self.logLayer.params |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
220 # construct a function that implements one step of finetunining |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
221 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
222 # compute the cost, defined as the negative log likelihood |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
223 cost = self.logLayer.negative_log_likelihood(self.y) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
224 # compute the gradients with respect to the model parameters |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
225 gparams = T.grad(cost, self.params) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
226 # compute list of updates |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
227 updates = {} |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
228 for param,gparam in zip(self.params, gparams): |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
229 updates[param] = param - gparam*finetune_lr |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
230 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
231 self.finetune = theano.function([index], cost, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
232 updates = updates, |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
233 givens = { |
139
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
234 self.x : train_set_x[index*batch_size:(index+1)*batch_size]/self.input_divider, |
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
235 self.y : train_set_y[index*batch_size:(index+1)*batch_size]} ) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
236 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
237 # symbolic variable that points to the number of errors made on the |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
238 # minibatch given by self.x and self.y |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
239 |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
240 self.errors = self.logLayer.errors(self.y) |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
241 |
139
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
242 @classmethod |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
243 def copy_reusing_lower_layers(cls, obj, num_hidden_layers, new_finetuning_lr=None): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
244 assert(num_hidden_layers <= obj.n_layers) |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
245 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
246 if not new_finetuning_lr: |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
247 new_finetuning_lr = obj.finetune_lr |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
248 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
249 new_sda = cls(train_set_x= obj.train_set_x, \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
250 train_set_y = obj.train_set_y,\ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
251 batch_size = obj.batch_size, \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
252 n_ins= obj.n_ins, \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
253 hidden_layers_sizes = obj.hidden_layers_sizes[:num_hidden_layers], \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
254 n_outs = obj.n_outs, \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
255 corruption_levels = obj.corruption_levels[:num_hidden_layers],\ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
256 rng = obj.rng,\ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
257 pretrain_lr = obj.pretrain_lr, \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
258 finetune_lr = new_finetuning_lr, \ |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
259 input_divider = obj.input_divider ) |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
260 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
261 # new_sda.layers contains only the hidden layers actually |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
262 for i, layer in enumerate(new_sda.layers): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
263 original_layer = obj.layers[i] |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
264 for p1,p2 in zip(layer.params, original_layer.params): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
265 p1.value = p2.value.copy() |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
266 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
267 return new_sda |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
268 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
269 def get_params_copy(self): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
270 return copy.deepcopy(self.params) |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
271 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
272 def set_params_from_copy(self, copy): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
273 # We don't want to replace the var, as the functions have pointers in there |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
274 # We only want to replace values. |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
275 for i, p in enumerate(self.params): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
276 p.value = copy[i].value |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
277 |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
278 def get_params_means(self): |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
279 s = [] |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
280 for p in self.params: |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
281 s.append(numpy.mean(p.value)) |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
282 return s |
7d8366fb90bf
Ajouté des __init__.py dans l'arborescence pour que les scripts puissent être utilisés avec des paths pour jobman, et fait pas mal de modifs dans stacked_dae pour pouvoir réutiliser le travail fait pour des tests où le pretraining est le même.
fsavard
parents:
131
diff
changeset
|
283 |
131
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
284 if __name__ == '__main__': |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
285 import sys |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
286 args = sys.argv[1:] |
5c79a2557f2f
Un peu de ménage dans code pour stacked DAE, splitté en fichiers dans un nouveau sous-répertoire.
savardf
parents:
diff
changeset
|
287 |