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annotate deep/stacked_dae/v_sylvain/utils.py @ 266:1e4e60ddadb1

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Merge. Ah, et dans le dernier commit, j'avais oublié de mentionner que j'ai ajouté du code pour gérer l'isolation de différents clones pour rouler des expériences et modifier le code en même temps.
author fsavard
date Fri, 19 Mar 2010 10:56:16 -0400
parents 8a94a5c808cd
children
rev   line source
230
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff changeset
1 #!/usr/bin/python
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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2 # coding: utf-8
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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3
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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4 from __future__ import with_statement
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5
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff changeset
6 from jobman import DD
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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7
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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8 # from pylearn codebase
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9 # useful in __init__(param1, param2, etc.) to save
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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10 # values in self.param1, self.param2... just call
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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11 # update_locals(self, locals())
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12 def update_locals(obj, dct):
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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13 if 'self' in dct:
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14 del dct['self']
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15 obj.__dict__.update(dct)
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16
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diff changeset
17 # from a dictionary of possible values for hyperparameters, e.g.
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18 # hp_values = {'learning_rate':[0.1, 0.01], 'num_layers': [1,2]}
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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19 # create a list of other dictionaries representing all the possible
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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20 # combinations, thus in this example creating:
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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21 # [{'learning_rate': 0.1, 'num_layers': 1}, ...]
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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22 # (similarly for combinations (0.1, 2), (0.01, 1), (0.01, 2))
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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23 def produit_cartesien_jobs(val_dict):
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24 job_list = [DD()]
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25 all_keys = val_dict.keys()
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26
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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diff changeset
27 for key in all_keys:
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
28 possible_values = val_dict[key]
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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29 new_job_list = []
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
30 for val in possible_values:
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
31 for job in job_list:
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32 to_insert = job.copy()
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33 to_insert.update({key: val})
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34 new_job_list.append(to_insert)
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
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35 job_list = new_job_list
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36
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diff changeset
37 return job_list
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parents:
diff changeset
38
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parents:
diff changeset
39 def test_produit_cartesien_jobs():
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diff changeset
40 vals = {'a': [1,2], 'b': [3,4,5]}
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41 print produit_cartesien_jobs(vals)
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42
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parents:
diff changeset
43
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parents:
diff changeset
44 # taken from http://stackoverflow.com/questions/276052/how-to-get-current-cpu-and-ram-usage-in-python
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45 """Simple module for getting amount of memory used by a specified user's
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46 processes on a UNIX system.
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47 It uses UNIX ps utility to get the memory usage for a specified username and
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48 pipe it to awk for summing up per application memory usage and return the total.
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49 Python's Popen() from subprocess module is used for spawning ps and awk.
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50
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diff changeset
51 """
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parents:
diff changeset
52
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parents:
diff changeset
53 import subprocess
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54
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diff changeset
55 class MemoryMonitor(object):
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diff changeset
56
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parents:
diff changeset
57 def __init__(self, username):
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parents:
diff changeset
58 """Create new MemoryMonitor instance."""
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parents:
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59 self.username = username
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parents:
diff changeset
60
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
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parents:
diff changeset
61 def usage(self):
8a94a5c808cd Repertoire pour faire les tests avec les differents ensembles pour le finetuning
SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
62 """Return int containing memory used by user's processes."""
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parents:
diff changeset
63 self.process = subprocess.Popen("ps -u %s -o rss | awk '{sum+=$1} END {print sum}'" % self.username,
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
64 shell=True,
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
65 stdout=subprocess.PIPE,
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parents:
diff changeset
66 )
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parents:
diff changeset
67 self.stdout_list = self.process.communicate()[0].split('\n')
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parents:
diff changeset
68 return int(self.stdout_list[0])
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SylvainPL <sylvain.pannetier.lebeuf@umontreal.ca>
parents:
diff changeset
69